Como director del Instituto de Estudios Históricos de las Revoluciones, Pedro Salmerón quedó en el centro de un escándalo mediático por llamar «valientes jóvenes» a los integrantes de la Liga 23 de Septiembre que en 1973 participaron en el secuestro que derivó en la muerte del empresario Eugenio Garza Sada. Tras dos días de revuelo en redes sociales, el historiador anunció por Twitter su renuncia al cargo. Horas después, negó que hubiera renunciado, pero la Secretaría de Cultura ya había nombrado un reemplazo